RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-216	ENST00000524481	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	NTRK3	Q16288	839 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	STAM	Q92783	540 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	GSTO1	P78417	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	BTAF1	O14981	1849 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	SRGN	P10124	158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	XBP1	P17861	261 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	IFNAR1	P17181	557 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	DEXI	O95424	95 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	CDC25A	P30304	524 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	PDE6B	P35913	854 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	GRIN1	Q05586	938 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	WASF1	Q92558	559 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	EYA3	Q99504	573 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ZNF202	O95125	648 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	EVC	P57679	992 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	AOC3	Q16853	763 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	PLIN2	Q99541	437 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	MCM7	P33993	719 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	SYK	P43405	635 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ATRN	O75882	1429 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	RAD17	O75943	681 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	NPR1	P16066	1061 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	AFM	P43652	599 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ELP1	O95163	1332 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	PFKFB1	P16118	471 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	CDK8	P49336	464 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	SEC23A	Q15436	765 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	USP49	Q70CQ1	688 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	MMP1	P03956	469 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	TROAP	Q12815	778 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PTPRK-216	ENST00000524481	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRK-216	ENST00000524481	NFIA	Q12857	509 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRK-216	ENST00000524481	PNOC	Q13519	176 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRK-216	ENST00000524481	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRK-216	ENST00000524481	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRK-216	ENST00000524481	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRK-216	ENST00000524481	FOXN1	O15353	648 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRK-216	ENST00000524481	AP5Z1	O43299	807 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRK-216	ENST00000524481	CASP1	P29466	404 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRK-216	ENST00000524481	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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