RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 MAPK8P45983 427 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 FAM161BQ96MY7 647 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ERVK-7P63135 1459 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 IQGAP1P46940 1657 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 DAPK1P53355 1430 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ROCK1Q13464 1354 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 METTL12A8MUP2 240 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 PDE3BQ13370 1112 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ZAR1Q86SH2 424 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.31□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 CYP26A1O43174 497 aa6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ADMP35318 185 aa6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 FBXL18Q96ME1 805 aa6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.3□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 A0A096LPE4 126 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PPZ6 126 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ABCC5O15440 1437 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ADH5P11766 374 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 DIP2AQ14689 1571 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 CCNJLQ8IV13 435 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 TET3O43151 1660 aa6.29□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 FAM170BA6NMN3 283 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 CYP11A1P05108 521 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 MAOBP27338 520 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 PCDH1Q08174 1060 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 CBLL1Q75N03 491 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 GATA6Q92908 595 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 PIK3R4Q99570 1358 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 CEP152O94986 1710 aa6.28□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 UNC13BO14795 1591 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRB3O60242 1522 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PP55 124 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 CTSBP07858 339 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 GRIA4P48058 902 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 MAP7Q14244 749 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 POU4F3Q15319 338 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 TCF12Q99081 682 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 PARP2Q9UGN5 583 aa6.27□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 RECKO95980 971 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 NFICP08651 508 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 CTSHP09668 335 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 DAB2P98082 770 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 CYP27A1Q02318 531 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 NOS1P29475 1434 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 RAB6AP20340 208 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 DYMQ7RTS9 669 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.25□□□□□ -1.41
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