RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 IL17RAQ96F46 866 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 XDHP47989 1333 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TSPY3P0CV98 308 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TSPY8P0CW00 308 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 GTF2IP78347 998 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 PDILTQ8N807 584 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TSC1Q92574 1164 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 KAT14Q9H8E8 782 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SENP2Q9HC62 589 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 GSTO1P78417 241 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TYRO3Q06418 890 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 RESTQ13127 1097 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZMYM6O95789 1325 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SLIT2O94813 1529 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TCHHQ07283 1943 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CTDNEP1O95476 244 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ADCY5O95622 1261 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TEX11Q8IYF3 940 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CTAGE5O15320 804 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TPM4P67936 248 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SETDB1Q15047 1291 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 NLRP5P59047 1200 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 BRAPQ7Z569 592 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 LUZP1Q86V48 1076 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 HOMER1Q86YM7 354 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 FANCBQ8NB91 859 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 124.7
TRPS1-208ENST00000519076 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 H0YHG0 523 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SEMA3EO15041 775 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L8P0C7I0 530 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CDC27P30260 824 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TFAP4Q01664 338 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 DOK7Q18PE1 504 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SLF2Q8IX21 1173 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ITGB4P16144 1822 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 BTBD18B2RXH4 712 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 MMP10P09238 476 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 CYP2D6P10635 497 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 ADRA2BP18089 450 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 ANO1Q5XXA6 986 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 CLIC4Q9Y696 253 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 GYS1P13807 737 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 SPECC1Q5M775 1068 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 RPAINQ86UA6 219 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 KRT222Q8N1A0 295 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 LY9Q9HBG7 655 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WWV3 80 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM22K7EJ46 135 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-208ENST00000519076 KIF5BP33176 963 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms