RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 TTC6Q86TZ1 520 aa18.26■□□□□ 0.51
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TRPS1-206ENST00000517323 GGA3Q9NZ52 723 aa18.26■□□□□ 0.51
TRPS1-206ENST00000517323 ORC4O43929 436 aa18.25■□□□□ 0.51
TRPS1-206ENST00000517323 GDF11O95390 407 aa18.25■□□□□ 0.51
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TRPS1-206ENST00000517323 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.25■□□□□ 0.51
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TRPS1-206ENST00000517323 MICU3Q86XE3 530 aa18.25■□□□□ 0.51
TRPS1-206ENST00000517323 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
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TRPS1-206ENST00000517323 TSPY8P0CW00 308 aa18.24■□□□□ 0.51
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TRPS1-206ENST00000517323 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
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TRPS1-206ENST00000517323 SEPT2Q15019 361 aa18.18■□□□□ 0.5
TRPS1-206ENST00000517323 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TRPS1-206ENST00000517323 FBXL16Q8N461 479 aa18.18■□□□□ 0.5
TRPS1-206ENST00000517323 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TRPS1-206ENST00000517323 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TRPS1-206ENST00000517323 ZBTB43O43298 467 aa18.17■□□□□ 0.5
TRPS1-206ENST00000517323 GH2P01242 217 aa18.17■□□□□ 0.5
TRPS1-206ENST00000517323 EVCP57679 992 aa18.17■□□□□ 0.5
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