RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517164.1

RNU6-1028P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1028, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1028P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SHDQ96IW2 340 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MSTNO14793 375 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CAP2P40123 477 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CDK5R2Q13319 367 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MLECQ14165 292 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLC6A19Q695T7 634 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PAOXQ6QHF9 649 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM13CQ8NE31 585 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GMIPQ9P107 970 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 STOML1Q9UBI4 398 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LRIG2O94898 1065 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IMPDH2P12268 514 aa7.39□□□□□ -1.23
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FOXQ1Q9C009 403 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GIPRP48546 466 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ARSHQ5FYA8 562 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ATG4CQ96DT6 458 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CRBNQ96SW2 442 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ATP2B1P20020 1258 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ADMP35318 185 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SHISA5Q8N114 240 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ETFBP38117 255 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GATA6Q92908 595 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLITRK5O94991 958 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RAG1P15918 1043 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZAR1Q86SH2 424 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FBXL6Q8N531 539 aa7.35□□□□□ -1.23
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RNU6-1028P-201ENST00000517164 DRC1Q96MC2 740 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KIF2CQ99661 725 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MIPEPQ99797 713 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DYRK3O43781 588 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LEFTY1O75610 366 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IGHA1P01876 353 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM87AP0C7U9 286 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ACRP10323 421 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NFIAQ12857 509 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RIN3Q8TB24 985 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLC9A7Q96T83 725 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TM9SF2Q99805 663 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM170BA6NMN3 283 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TNFRSF10CO14798 259 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FSTP19883 344 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GUCY2CP25092 1073 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 USP35Q9P2H5 1018 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 UBOX5O94941 541 aa7.32□□□□□ -1.24
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