RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BMP4P12644 408 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LIG1P18858 919 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITGA6P23229 1130 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAOBP27338 520 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PMLP29590 882 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRK4P32298 578 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GUCY2FP51841 1108 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C12orf40Q86WS4 652 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT82Q9NSB4 513 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF862O60290 1169 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTSBP07858 339 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SDSP20132 328 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARL4DP49703 201 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNFRSF25Q93038 417 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDC14CA4D256 554 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINC01387J3KSC0 135 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KATNA1O75449 491 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARAFP10398 606 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUDT8Q8WV74 236 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSPAN6O43657 245 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPHB1P54762 984 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP2R2AP63151 447 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP2R5AQ15172 486 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC41Q15345 812 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PKDCCQ504Y2 493 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM13CQ8NE31 585 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC6A18Q96N87 628 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APBA2Q99767 749 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LGR4Q9BXB1 951 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PICK1Q9NRD5 415 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLF15Q9UIH9 416 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RASGRP1O95267 797 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAT2P11245 290 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHBDL3P58872 404 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIP4K2BP78356 416 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STRN3Q13033 797 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BBS9Q3SYG4 887 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM192Q8IY95 271 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RIN3Q8TB24 985 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DACH1Q9UI36 760 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHTN1A0MZ66 631 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRODHO43272 600 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITGAVP06756 1048 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPHX1P07099 455 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CPEP16870 476 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.56□□□□□ -1.36
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