RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 TBC1D8O95759 1140 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 SDSP20132 328 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 GABPAQ06546 454 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 TTC22Q5TAA0 569 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 CTR9Q6PD62 1173 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 CABP5Q9NP86 173 aa21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM75PA6NK02 468 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 SHMT1P34896 483 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 SBK1Q52WX2 424 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.41■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 GH2P01242 217 aa21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 SPP2Q13103 211 aa21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 FAM227BQ96M60 508 aa21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 NAPBQ9H115 298 aa21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 LAMB1P07942 1786 aa21.4■■□□□ 1.02
FAAP20-215ENST00000514625 A0A0D9SFI3 127 aa21.39■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.39■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 BTBD19C9JJ37 291 aa21.39■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 EVX2Q03828 476 aa21.39■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.39■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.39■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 WDR18Q9BV38 432 aa21.39■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 CDK8P49336 464 aa21.38■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.38■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.38■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.38■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.38■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.38■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 JAG1P78504 1218 aa21.37■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.37■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC17Q96LX7 622 aa21.37■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.37■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 GPR25O00155 361 aa21.36■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 CRHR2Q13324 411 aa21.36■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.36■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.36■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.35■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 C19orf81C9J6K1 198 aa21.35■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L10C9JJH3 530 aa21.35■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 PDHXO00330 501 aa21.35■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 BACE1P56817 501 aa21.35■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 MOGSQ13724 837 aa21.35■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.35■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 HMGCS2P54868 508 aa21.34■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 MTMR2Q13614 643 aa21.34■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.34■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 FEZ1Q99689 392 aa21.34■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.34■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 SMIM22K7EJ46 135 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 FKTNO75072 461 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 PDE4BQ07343 736 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 PPARAQ07869 468 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 SEPT2Q15019 361 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 ALX1Q15699 326 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 VPS53Q5VIR6 699 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.33■■□□□ 1.01
FAAP20-215ENST00000514625 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.33■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.32■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 AKR1B1P15121 316 aa21.32■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.32■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.32■■□□□ 1
FAAP20-215ENST00000514625 TLR2O60603 784 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms