RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 ATP7BP35670 1465 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 SETDB1Q15047 1291 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 FSCN2O14926 492 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 ELNP15502 786 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 GSTT1P30711 240 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 DAB2P98082 770 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 IKBKEQ14164 716 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF576Q9H609 170 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 AK5Q9Y6K8 562 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.8□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 FAM229AH3BQW9 127 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 CDC25BP30305 580 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 FCGRTP55899 365 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 PSMD2Q13200 908 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 TMC4Q7Z404 712 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 RNF19AQ9NV58 838 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.79□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 ARL4DP49703 201 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 PCDH1Q08174 1060 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 BCL11AQ9H165 835 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.78□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa9.77□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
PDE4D-222ENST00000514552 DLL1O00548 723 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 RASSF7Q02833 373 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.77□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
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PDE4D-222ENST00000514552 LRP5O75197 1615 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 TM4SF5O14894 197 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 GSK3AP49840 483 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 DCAF5Q96JK2 942 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.76□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-222ENST00000514552 B3GALT4O96024 378 aa9.75□□□□□ -0.85
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PDE4D-222ENST00000514552 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 NACC1Q96RE7 527 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 MRS2Q9HD23 443 aa9.75□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 SORBS3O60504 671 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 APBA3O96018 575 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 USP17L7P0C7H9 530 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 GRIK4Q16099 956 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 BTG4Q9NY30 223 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.74□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 FAM161BQ96MY7 647 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 CPDO75976 1380 aa9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 C9orf172C9J069 976 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 HGSNATQ68CP4 663 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
PDE4D-222ENST00000514552 KRBA1A5PL33 1030 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-222ENST00000514552 GDF11O95390 407 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-222ENST00000514552 SELPP16109 830 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-222ENST00000514552 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-222ENST00000514552 GSTM4Q03013 218 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-222ENST00000514552 FAAP100Q0VG06 881 aa9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-222ENST00000514552 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-222ENST00000514552 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-222ENST00000514552 CEP44Q9C0F1 390 aa9.71□□□□□ -0.86
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