RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512855.5

FAM200B-218, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM200B, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-218ENST00000512855 WDR18Q9BV38 432 aa27.36■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 LNPKQ9C0E8 428 aa27.36■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.36■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa27.36■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 GDF11O95390 407 aa27.35■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa27.35■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 ADGRA2Q96PE1 1338 aa27.35■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 SHMT1P34896 483 aa27.34■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 EVX2Q03828 476 aa27.34■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.34■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.34■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa27.34■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.34■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 CAPN15O75808 1086 aa27.33■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 CYP2D6P10635 497 aa27.33■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 NUCB1Q02818 461 aa27.33■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.33■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.33■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.33■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 CD99L2Q8TCZ2 262 aa27.33■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa27.33■■□□□ 1.97
FAM200B-218ENST00000512855 CAP1Q01518 475 aa27.32■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 C17orf99Q6UX52 265 aa27.32■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 FSD1Q9BTV5 496 aa27.32■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 GH2P01242 217 aa27.31■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 OTOP1Q7RTM1 612 aa27.31■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 USP17L12C9JPN9 530 aa27.3■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 USP17L21D6R901 530 aa27.3■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 HMGCS2P54868 508 aa27.3■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 BACE1P56817 501 aa27.3■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 C12orf60Q5U649 245 aa27.3■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.3■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 GSG1L2A8MUP6 293 aa27.29■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 GPAA1O43292 621 aa27.29■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 CYP2C8P10632 490 aa27.29■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.29■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 TREML2Q5T2D2 321 aa27.29■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 EVI5LQ96CN4 794 aa27.29■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 SWAP70Q9UH65 585 aa27.29■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 CPA4Q9UI42 421 aa27.29■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 TRIM17Q9Y577 477 aa27.29■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 C19orf81C9J6K1 198 aa27.28■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 M0R2C6 588 aa27.28■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 MTMR2Q13614 643 aa27.28■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa27.28■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 GIMAP6Q6P9H5 292 aa27.28■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 CTR9Q6PD62 1173 aa27.28■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa27.27■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 USP17L10C9JJH3 530 aa27.27■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 AMOTL1Q8IY63 956 aa27.27■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 SLC44A5Q8NCS7 719 aa27.27■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.27■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 EFCC1Q9HA90 598 aa27.27■■□□□ 1.96
FAM200B-218ENST00000512855 SMIM22K7EJ46 135 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 BCRP11274 1271 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 GNAT2P19087 354 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 GUCY1A2P33402 732 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 SBK1Q52WX2 424 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 OSBPL3Q9H4L5 887 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 CABP5Q9NP86 173 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 HPS5Q9UPZ3 1129 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC85CA6NKD9 419 aa27.25■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 MYH8P13535 1937 aa27.24■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.24■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 ARHGEF6Q15052 776 aa27.24■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 C16orf86Q6ZW13 317 aa27.24■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 TICAM2Q86XR7 235 aa27.24■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 TMOD4Q9NZQ9 345 aa27.24■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 PNMA3Q9UL41 463 aa27.24■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa27.23■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 CDK8P49336 464 aa27.23■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa27.23■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 PTPN22Q9Y2R2 807 aa27.23■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 KIF22Q14807 665 aa27.22■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 SEPT2Q15019 361 aa27.22■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 EMILIN3Q9NT22 766 aa27.22■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 CTGFP29279 349 aa27.21■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 USP17L2Q6R6M4 530 aa27.21■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 C12orf42Q96LP6 360 aa27.21■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC17Q96LX7 622 aa27.21■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa27.21■■□□□ 1.95
FAM200B-218ENST00000512855 GNRH1P01148 92 aa27.2■■□□□ 1.94
FAM200B-218ENST00000512855 OSBPP22059 807 aa27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms