RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 GSTT1P30711 240 aa9.52□□□□□ -0.89
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HERC3-210ENST00000512194 OSMRQ99650 979 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-210ENST00000512194 SYT17Q9BSW7 474 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-210ENST00000512194 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HERC3-210ENST00000512194 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HERC3-210ENST00000512194 BTAF1O14981 1849 aa9.52□□□□□ -0.89
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HERC3-210ENST00000512194 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-210ENST00000512194 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-210ENST00000512194 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-210ENST00000512194 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.46□□□□□ -0.9
HERC3-210ENST00000512194 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-210ENST00000512194 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HERC3-210ENST00000512194 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-210ENST00000512194 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-210ENST00000512194 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-210ENST00000512194 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HERC3-210ENST00000512194 SLC15A2Q16348 729 aa9.45□□□□□ -0.9
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