RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYPNQ86TC9 1320 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3D19Q5HYK7 790 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MGAMO43451 1857 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CENPFP49454 3210 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTMR2Q13614 643 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMOD4Q9NZQ9 345 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EN2P19622 333 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BACE1P56817 501 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC285556D6RIA3 1793 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HAUS7Q99871 368 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EHD4Q9H223 541 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C19orf81C9J6K1 198 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP17L10C9JJH3 530 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GH2P01242 217 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRKCZQ05513 592 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRK4P32298 578 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TATDN1Q6P1N9 297 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLCD1P51178 756 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCORLQ8N3X6 602 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCTPP1Q9H773 170 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GABRQQ9UN88 632 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADD2P35612 726 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM110CQ1W6H9 321 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARMT1Q9H993 441 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CABP5Q9NP86 173 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COA7Q96BR5 231 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MBD4O95243 580 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FLT3LGP49771 235 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTFR1Q15390 333 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP17L2Q6R6M4 530 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FEZ1Q99689 392 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHMT1P34896 483 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLAIN1Q8ND83 568 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPATCH3Q96I76 525 aa28.15■■■□□ 2.1
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBXN2AP68543 259 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EMILIN3Q9NT22 766 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYH7P12883 1935 aa28.14■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRKAB2O43741 272 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBE3CQ15386 1083 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.13■■■□□ 2.09
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 GABPAQ06546 454 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.12■■■□□ 2.09
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 HERVK_113P62684 666 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IRF5Q13568 498 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MORF4L1Q9UBU8 362 aa28.11■■■□□ 2.09
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP14P54578 494 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACER1Q8TDN7 264 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF208Q9H0X6 261 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PXYLP1Q8TE99 480 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEPT2Q15019 361 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DYNLL2Q96FJ2 89 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C12orf42Q96LP6 360 aa28.08■■■□□ 2.09
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