RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498075.1

PNISR-210, Transcript of PNN interacting serine and arginine rich protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PNISR, Length 1,027 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNISR-210ENST00000498075 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.31□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.31□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.31□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.31□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 SLX4Q8IY92 1834 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 LILRB5O75023 590 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 NFKB1P19838 968 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 TM4SF1P30408 202 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 ARSDP51689 593 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 IFT43Q96FT9 208 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 ATG3Q9NT62 314 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 BCORQ6W2J9 1755 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 RTL1A6NKG5 1358 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 INSRP06213 1382 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.3□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 PRMT3O60678 531 aa7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 MAP3K6O95382 1288 aa7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 NID1P14543 1247 aa7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 EPHX2P34913 555 aa7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 STK32AQ8WU08 396 aa7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 HACL1Q9UJ83 578 aa7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.29□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 OPLAHO14841 1288 aa7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 ATG7O95352 703 aa7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 PCSK7Q16549 785 aa7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 OCLNQ16625 522 aa7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 COX20Q5RI15 118 aa7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 CST9Q5W186 159 aa7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.28□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.27□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 NCAPD2Q15021 1401 aa7.27□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 CEP290O15078 2479 aa7.27□□□□□ -1.24
PNISR-210ENST00000498075 FAM229AH3BQW9 127 aa7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 FURINP09958 794 aa7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 AMPHP49418 695 aa7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 NUDT8Q8WV74 236 aa7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 ZFATQ9P243 1243 aa7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 COL6A3P12111 3177 aa7.26□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 TRAF5O00463 557 aa7.26□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 SASH3O75995 380 aa7.26□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 FBLN1P23142 703 aa7.26□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 GATA4P43694 442 aa7.26□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.26□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 TREML1Q86YW5 311 aa7.26□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 NAGPAQ9UK23 515 aa7.26□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 A0A1W2PP64 1363 aa7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 H0YIN7 160 aa7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 RARAP10276 462 aa7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 NFIXQ14938 502 aa7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 FAM35AQ86V20 835 aa7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 COL26A1Q96A83 441 aa7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 USP20Q9Y2K6 914 aa7.25□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 EGFRP00533 1210 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 GRIK4Q16099 956 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 C16orf46Q6P387 395 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 NACC1Q96RE7 527 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.23□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 A0A0A0MRY4 1105 aa7.23□□□□□ -1.25
PNISR-210ENST00000498075 XYLBO75191 536 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms