RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 OCSTAMPQ9BR26 566 aa11.69□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 DBNDD1Q9H9R9 158 aa11.69□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 LRP2BPQ9P2M1 347 aa11.69□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 CHD4Q14839 1912 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 RNF223E7ERA6 249 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 LMNB1P20700 586 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 GSTO1P78417 241 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 GPR162Q16538 588 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 PI16Q6UXB8 463 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 ABCF2Q9UG63 623 aa11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 USP17L3A6NCW0 530 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 USP17L4A6NCW7 530 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 RASSF7Q02833 373 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 CERS3Q8IU89 383 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 RAI14Q9P0K7 980 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 REC8O95072 547 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 EIF6P56537 245 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 GTF2IP78347 998 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 PTK2Q05397 1052 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 ANKLE1Q8NAG6 615 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 APPBP2Q92624 585 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 SCN9AQ15858 1988 aa11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 COL4A5P29400 1685 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 PDE6AP16499 860 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 CHMLP26374 656 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 TNIP1Q15025 636 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 UBE3CQ15386 1083 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 ANTXR1Q9H6X2 564 aa11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-211ENST00000497210 SBF1O95248 1867 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 LDHCP07864 332 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 PRDX5P30044 214 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 ADD2P35612 726 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 GGCXP38435 758 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 MMP14P50281 582 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 C8orf34Q49A92 452 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 MAGEB6Q8N7X4 407 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 JAG2Q9Y219 1238 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 SEMA3FQ13275 785 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 DACT2Q5SW24 774 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 HOMEZQ8IX15 550 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 BAP1Q92560 729 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 AIDAQ96BJ3 306 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 UCN2Q96RP3 112 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 RNF181Q9P0P0 153 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 UTRNP46939 3433 aa11.63□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 MYH2Q9UKX2 1941 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0D9SFI3 127 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 YDJCA8MPS7 323 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 BAG3O95817 575 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 GNAT2P19087 354 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 CYP7A1P22680 504 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 MECOMQ03112 1051 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01559Q495D7 138 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 OGFOD1Q8N543 542 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF511Q8NB15 262 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-211ENST00000497210 TEKT1Q969V4 418 aa11.62□□□□□ -0.55
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