RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494971.2

USP20-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 3

Gene USP20, Length 503 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-208ENST00000494971 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.59■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 GDF11O95390 407 aa20.58■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.58■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.58■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 SMC5Q8IY18 1101 aa20.58■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.58■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 TRIM17Q9Y577 477 aa20.58■□□□□ 0.89
USP20-208ENST00000494971 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.57■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 PRKAB2O43741 272 aa20.57■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 SHMT1P34896 483 aa20.57■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 EFCC1Q9HA90 598 aa20.57■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 STAP2Q9UGK3 403 aa20.57■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.57■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.57■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 APPBP2Q92624 585 aa20.56■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 CYP2C8P10632 490 aa20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 BCRP11274 1271 aa20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 HMGCS2P54868 508 aa20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 BACE1P56817 501 aa20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 ARHGEF6Q15052 776 aa20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 TREML2Q5T2D2 321 aa20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 OSBP2Q969R2 916 aa20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 CPA4Q9UI42 421 aa20.55■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 GH2P01242 217 aa20.54■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 IGHDP01880 384 aa20.54■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 EVX2Q03828 476 aa20.54■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.54■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.54■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 C19orf81C9J6K1 198 aa20.53■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 USP17L10C9JJH3 530 aa20.53■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 CYP2D6P10635 497 aa20.53■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 PDE1AP54750 535 aa20.53■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 MTMR2Q13614 643 aa20.53■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 SWAP70Q9UH65 585 aa20.53■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 KIF22Q14807 665 aa20.52■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.52■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 C12orf60Q5U649 245 aa20.52■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.52■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 PNMA3Q9UL41 463 aa20.52■□□□□ 0.88
USP20-208ENST00000494971 CENPFP49454 3210 aa20.51■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.51■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 USP17L12C9JPN9 530 aa20.51■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 USP17L21D6R901 530 aa20.51■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 GNRH1P01148 92 aa20.51■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.51■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.51■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 LNPKQ9C0E8 428 aa20.51■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 CABP5Q9NP86 173 aa20.51■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.5■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 GPAA1O43292 621 aa20.5■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 GUCY1A2P33402 732 aa20.5■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 NUCB1Q02818 461 aa20.5■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 CTR9Q6PD62 1173 aa20.5■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.5■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 FSD1Q9BTV5 496 aa20.5■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.5■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 M0R2C6 588 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 GNAT2P19087 354 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 CTGFP29279 349 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 RGS19P49795 217 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 SBK1Q52WX2 424 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 C12orf42Q96LP6 360 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 MYH8P13535 1937 aa20.49■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 SMIM22K7EJ46 135 aa20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 OSBPP22059 807 aa20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 PRMT2P55345 433 aa20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 EVI5LQ96CN4 794 aa20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 TRIM47Q96LD4 638 aa20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.48■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 PSMC4P43686 418 aa20.47■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 CDK8P49336 464 aa20.47■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 SEPT2Q15019 361 aa20.47■□□□□ 0.87
USP20-208ENST00000494971 TICAM2Q86XR7 235 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms