RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.34■■□□□ 1.33
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.21■■□□□ 1.31
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C12orf42Q96LP6 360 aa23.2■■□□□ 1.3
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP17L15C9J2P7 530 aa23.19■■□□□ 1.3
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