RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 KRT23Q9C075 422 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 MED4Q9NPJ6 270 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.4□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 NBPF3Q9H094 633 aa8.39□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 TEX11Q8IYF3 940 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF217Q8TC41 542 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 JDP2Q8WYK2 163 aa8.38□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 TMX3Q96JJ7 454 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 CASQ1P31415 396 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.38□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.38□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 CAPN15O75808 1086 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 CPA1P15085 419 aa8.37□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 TNIP1Q15025 636 aa8.37□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.37□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 PSMD14O00487 310 aa8.37□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.37□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.37□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 PRC1O43663 620 aa8.36□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.36□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 ANTXR2P58335 489 aa8.36□□□□□ -1.07
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SMARCE1-211ENST00000493660 PDE4BQ07343 736 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 SGSM3Q96HU1 749 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 SYT17Q9BSW7 474 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 IDI2Q9BXS1 227 aa8.36□□□□□ -1.07
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