RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491264.5

HOXB-AS3-213, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 478 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PDE1AP54750 535 aa23.75■■□□□ 1.39
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.75■■□□□ 1.39
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.75■■□□□ 1.39
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 TRIM17Q9Y577 477 aa23.74■■□□□ 1.39
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L21D6R901 530 aa23.71■■□□□ 1.39
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.68■■□□□ 1.38
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 C17orf99Q6UX52 265 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.68■■□□□ 1.38
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.67■■□□□ 1.38
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.67■■□□□ 1.38
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.67■■□□□ 1.38
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.65■■□□□ 1.38
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 TICAM2Q86XR7 235 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCDC17Q96LX7 622 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GNRH1P01148 92 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SEPT2Q15019 361 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SBK1Q52WX2 424 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PTPRFP10586 1907 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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HOXB-AS3-213ENST00000491264 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.63■■□□□ 1.37
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