RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-208ENST00000486192 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.63□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC17Q96LX7 622 aa10.63□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 IL25Q9H293 177 aa10.63□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 ANO2Q9NQ90 1003 aa10.63□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.63□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 LDLRAD1Q5T700 205 aa10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 RNF20Q5VTR2 975 aa10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 MOB2Q70IA6 237 aa10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 WRNIP1Q96S55 665 aa10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CSADQ9Y600 493 aa10.62□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 PHF20L1A8MW92 1017 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 MINDY4BA8MYZ0 360 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 USP2O75604 605 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 ASNSP08243 561 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 SLC10A3P09131 477 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 FGRP09769 529 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 MAP3K9P80192 1104 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 MIGA2Q7L4E1 593 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 DNAJC18Q9H819 358 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CNNM2Q9H8M5 875 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 MKNK2Q9HBH9 465 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.61□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 ORC4O43929 436 aa10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CAP2P40123 477 aa10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CDK8P49336 464 aa10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 PTH1RQ03431 593 aa10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 AKNAD1Q5T1N1 836 aa10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 SCYL3Q8IZE3 742 aa10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CABP5Q9NP86 173 aa10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 PICK1Q9NRD5 415 aa10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CYP2D6P10635 497 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 MCCP23508 829 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 SHMT1P34896 483 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 TRDNQ13061 729 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 VGLL4Q14135 290 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 KRT32Q14532 448 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 NECTIN1Q15223 517 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 TSGA10IPQ3SY00 556 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 C8orf34Q49A92 452 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 TMEM179Q6ZVK1 233 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 KRT23Q9C075 422 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
SORCS1-208ENST00000486192 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 PLIN4Q96Q06 1357 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 CYP21A2P08686 494 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 PPATQ06203 517 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 PRKG1Q13976 671 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC178Q5BJE1 867 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 ERO1BQ86YB8 467 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 ESR2Q92731 530 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 DYNLL2Q96FJ2 89 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 AS3MTQ9HBK9 375 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.58□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 POTEFA5A3E0 1075 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 FAM196BA6NMK8 535 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 USP17L5A8MUK1 530 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 PTPRAP18433 802 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 RASA1P20936 1047 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 INPP5BP32019 993 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 HSPA4P34932 840 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 HAND2P61296 217 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 KCNB2Q92953 911 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 MTA3Q9BTC8 594 aa10.57□□□□□ -0.72
SORCS1-208ENST00000486192 USP26Q9BXU7 913 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms