RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 COG6Q9Y2V7 657 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 C19orf81C9J6K1 198 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 GDF11O95390 407 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 CCL5P13501 91 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 MTMR2Q13614 643 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 HTTP42858 3142 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 BACE1P56817 501 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 TTC6Q86TZ1 520 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 USP17L10C9JJH3 530 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 GJB1P08034 283 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 IRF5Q13568 498 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC18Q9H819 358 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 RAB11FIP3O75154 756 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 GJA8P48165 433 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTB-212ENST00000484841 INHAP05111 366 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 ELNP15502 786 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 DPF3Q92784 378 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 FEZ1Q99689 392 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 EHD4Q9H223 541 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 CABP5Q9NP86 173 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 GH2P01242 217 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 CENPFP49454 3210 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 GOLIM4O00461 696 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 CAPN2P17655 700 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 JAG1P78504 1218 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 SHISA4Q96DD7 197 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 SGPL1O95470 568 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 PDE6AP16499 860 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 HERVK_113P62684 666 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.39■■□□□ 1.5
ACTB-212ENST00000484841 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 USP14P54578 494 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 DEFB118Q96PH6 123 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.498e-19■□□□□ 10.2
ACTB-212ENST00000484841 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 PDE3AQ14432 1141 aa24.38■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 HMGCRP04035 888 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 USP17L15C9J2P7 530 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 USP17L11C9JVI0 530 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 USP17L18D6R9N7 530 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 USP17L22D6RA61 530 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 USP17L19D6RCP7 530 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 USP17L20D6RJB6 530 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 MAPK4P31152 587 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 PLCD1P51178 756 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 USP17L24Q0WX57 530 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 H0YGN5 161 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 CYP2B6P20813 491 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.6 ms