RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484571.5

VWA3B-215, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 3

Gene VWA3B, Length 717 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-215ENST00000484571 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 HMGCS2P54868 508 aa24.88■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF333Q96JL9 665 aa24.88■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 TRIM47Q96LD4 638 aa24.88■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.88■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.88■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 USP17L10C9JJH3 530 aa24.87■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 TREML2Q5T2D2 321 aa24.87■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 BCL11AQ9H165 835 aa24.87■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.87■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 MYH1P12882 1939 aa24.86■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 GABPAQ06546 454 aa24.86■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.86■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 LCORLQ8N3X6 602 aa24.86■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.86■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.86■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 GDF11O95390 407 aa24.85■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 JAG1P78504 1218 aa24.85■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 MTMR2Q13614 643 aa24.85■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 GH2P01242 217 aa24.84■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 CTGFP29279 349 aa24.84■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 PLCD1P51178 756 aa24.84■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.84■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 CABP5Q9NP86 173 aa24.84■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 SWAP70Q9UH65 585 aa24.84■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 MBD4O95243 580 aa24.83■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 USP14P54578 494 aa24.83■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.83■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.83■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.83■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 C12orf42Q96LP6 360 aa24.83■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.83■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 ARMT1Q9H993 441 aa24.83■■□□□ 1.57
VWA3B-215ENST00000484571 MYPNQ86TC9 1320 aa24.83■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 ERC2O15083 957 aa24.82■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 SHMT1P34896 483 aa24.82■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.82■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.82■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.82■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 RAET1EQ8TD07 263 aa24.82■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.82■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.8■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 GCC1Q96CN9 775 aa24.8■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 CRBNQ96SW2 442 aa24.8■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.8■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.8■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 GRK4P32298 578 aa24.79■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 IRF5Q13568 498 aa24.79■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.79■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 PRKCZQ05513 592 aa24.78■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.78■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.78■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 COA7Q96BR5 231 aa24.78■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.78■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 CENPFP49454 3210 aa24.78■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.77■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.77■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 APPBP2Q92624 585 aa24.77■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 CCDC17Q96LX7 622 aa24.77■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 FEZ1Q99689 392 aa24.77■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
VWA3B-215ENST00000484571 MYH7P12883 1935 aa24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 POTEFA5A3E0 1075 aa24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 PRKAB2O43741 272 aa24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 CAPN2P17655 700 aa24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 HERVK_113P62684 666 aa24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 C12orf60Q5U649 245 aa24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.76■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 GNAT2P19087 354 aa24.75■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 UBXN2AP68543 259 aa24.75■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 USP17L15C9J2P7 530 aa24.74■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.74■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 USP17L11C9JVI0 530 aa24.74■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 USP17L18D6R9N7 530 aa24.74■■□□□ 1.55
VWA3B-215ENST00000484571 USP17L22D6RA61 530 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms