RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 ELNP15502 786 aa26.23■■□□□ 1.79
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USP40-215ENST00000484528 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.23■■□□□ 1.79
USP40-215ENST00000484528 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
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USP40-215ENST00000484528 RNF208Q9H0X6 261 aa26.21■■□□□ 1.79
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USP40-215ENST00000484528 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.2■■□□□ 1.78
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USP40-215ENST00000484528 PEX10O60683 326 aa26.18■■□□□ 1.78
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USP40-215ENST00000484528 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.17■■□□□ 1.78
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USP40-215ENST00000484528 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.16■■□□□ 1.78
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USP40-215ENST00000484528 RAB11FIP3O75154 756 aa26.15■■□□□ 1.78
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USP40-215ENST00000484528 HERVK_113P62684 666 aa26.13■■□□□ 1.77
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USP40-215ENST00000484528 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa26.08■■□□□ 1.77
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USP40-215ENST00000484528 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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