RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 GPR182O15218 404 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 DLG4P78352 724 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 FGD1P98174 961 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 TMC7Q7Z402 723 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 PANK1Q8TE04 598 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 MYLIPQ8WY64 445 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 FOXQ1Q9C009 403 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 RNF32Q9H0A6 362 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 KRT82Q9NSB4 513 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-208ENST00000483859 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 USP5P45974 858 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ORC1Q13415 861 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 SSPNQ14714 243 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ZNF605Q86T29 641 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 C12orf40Q86WS4 652 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 UBE2FQ969M7 185 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 SLITRK5O94991 958 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ERVK-24P63145 666 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 VMACQ2NL98 169 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 CXorf38Q8TB03 319 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ASB16Q96NS5 453 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 SETDB2Q96T68 719 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 FAM129BQ96TA1 746 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ADAMTS10Q9H324 1103 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ST14Q9Y5Y6 855 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.75□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 RIN3Q8TB24 985 aa5.75□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 GCM1Q9NP62 436 aa5.75□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 RNF19AQ9NV58 838 aa5.75□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 KCTD3Q9Y597 815 aa5.75□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 NDUFB5O43674 189 aa5.74□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 CBX7O95931 251 aa5.74□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 CELA3BP08861 270 aa5.74□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 RAC2P15153 192 aa5.74□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 DSC3Q14574 896 aa5.74□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.74□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.74□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 SP110Q9HB58 689 aa5.74□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ADRB1P08588 477 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 GALK1P51570 392 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 SULF2Q8IWU5 870 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 MFSD4AQ8N468 514 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 SYT8Q8NBV8 401 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 NIF3L1Q9GZT8 377 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 PICK1Q9NRD5 415 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 TREHO43280 583 aa5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 HPXP02790 462 aa5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ESR1P03372 595 aa5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 SRFP11831 508 aa5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 INSRRP14616 1297 aa5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 TMC1Q8TDI8 760 aa5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 ACSBG1Q96GR2 724 aa5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.72□□□□□ -1.49
SENP6-208ENST00000483859 UNCXA6NJT0 531 aa5.71□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 FCGRTP55899 365 aa5.71□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 GRM2Q14416 872 aa5.71□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.52e-6■□□□□ 8.9
SENP6-208ENST00000483859 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.71□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.71□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.71□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 PI3P19957 117 aa5.7□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.7□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 MIPEPQ99797 713 aa5.7□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 FBRSQ9HAH7 460 aa5.7□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 CBX8Q9HC52 389 aa5.7□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 ARNTP27540 789 aa5.69□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 MAPK8P45983 427 aa5.69□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 RING1Q06587 406 aa5.69□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 ZNF385BQ569K4 471 aa5.69□□□□□ -1.5
SENP6-208ENST00000483859 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms