RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-208ENST00000479480 HMG20BQ9P0W2 317 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-208ENST00000479480 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-208ENST00000479480 FOXK1P85037 733 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SLF2Q8IX21 1173 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 COA7Q96BR5 231 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 NEUROD6Q96NK8 337 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 METRNQ9UJH8 293 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 C2orf72A6NCS6 295 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 CAP2P40123 477 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 HMGCS2P54868 508 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 FAM110CQ1W6H9 321 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 NECAB2Q7Z6G3 386 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF280CQ8ND82 737 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 GDF15Q99988 308 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 TNNQ9UQP3 1299 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L5A8MUK1 530 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 DLL1O00548 723 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SRGAP3O43295 1099 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 MVPQ14764 893 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 Q3C1V9 767 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SPATA5Q8NB90 893 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 RAI14Q9P0K7 980 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 AKAP2Q9Y2D5 859 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 RPTORQ8N122 1335 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 LDHCP07864 332 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SYN1P17600 705 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 CYP2B6P20813 491 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 MCAMP43121 646 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 TRIB2Q92519 343 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SNRKQ9NRH2 765 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 PNMA3Q9UL41 463 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 AK9Q5TCS8 1911 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PPC1 479 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 SEC24BO95487 1268 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 HMGCRP04035 888 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 CAPN2P17655 700 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 BMP8BP34820 402 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 MTX1Q13505 466 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 TEX11Q8IYF3 940 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 WDR18Q9BV38 432 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 NBPF3Q9H094 633 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJC18Q9H819 358 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 RBPJLQ9UBG7 517 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 MORF4L1Q9UBU8 362 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 BACE1P56817 501 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 GSTO1P78417 241 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 MTMR2Q13614 643 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 GORABQ5T7V8 394 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 Q7L0L9 218 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 ADGRA1Q86SQ6 560 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 C11orf49Q9H6J7 331 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 LRP2BPQ9P2M1 347 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 PI4KBQ9UBF8 816 aa10.4□□□□□ -0.74
CTPS1-208ENST00000479480 GDF11O95390 407 aa10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-208ENST00000479480 GNAI3P08754 354 aa10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-208ENST00000479480 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-208ENST00000479480 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-208ENST00000479480 PPP4CP60510 307 aa10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-208ENST00000479480 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-208ENST00000479480 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-208ENST00000479480 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-208ENST00000479480 CCL14Q16627 93 aa10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-208ENST00000479480 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-208ENST00000479480 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
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