RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 JAG1P78504 1218 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARMT1Q9H993 441 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 PNMA3Q9UL41 463 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 BCRP11274 1271 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 HMGCS2P54868 508 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 TREML2Q5T2D2 321 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 ERC2O15083 957 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLCD1P51178 756 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 SOX10P56693 466 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 BACE1P56817 501 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTMR2Q13614 643 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 GCC1Q96CN9 775 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 SHMT1P34896 483 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRMT2P55345 433 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 GABPAQ06546 454 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 C19orf81C9J6K1 198 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 GH2P01242 217 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHGBP05060 677 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 MX1P20591 662 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARMC5Q96C12 935 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP17L10C9JJH3 530 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM47Q96LD4 638 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRKAB2O43741 272 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTGFP29279 349 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSMC4P43686 418 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 APPBP2Q92624 585 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 SWAP70Q9UH65 585 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 OSBPP22059 807 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 FCGRTP55899 365 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.68■■□□□ 1.22
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TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 CABP5Q9NP86 173 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 SRRDQ9UH36 339 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 FEZ1Q99689 392 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRCA2P51587 3418 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYPNQ86TC9 1320 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 C12orf60Q5U649 245 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF11Q86T75 865 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF333Q96JL9 665 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 C12orf42Q96LP6 360 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC10-208ENST00000469521 GUCY1A2P33402 732 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP14P54578 494 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 OSBP2Q969R2 916 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP17L12C9JPN9 530 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP17L21D6R901 530 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC10-208ENST00000469521 FSD1Q9BTV5 496 aa22.63■■□□□ 1.21
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