RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, human

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA1-209	ENST00000469140	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	DDIT3	P35638	169 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	STK3	Q13188	491 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	SEC23A	Q15436	765 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	TSPY3	P0CV98	308 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	TSPY8	P0CW00	308 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC69	A6NI79	296 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	EGFR	P00533	1210 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	TNNI2	P48788	182 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	ST3GAL1	Q11201	340 aa		27.66	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	CNTNAP1	P78357	1384 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	TNFAIP1	Q13829	316 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	APOA5	Q6Q788	366 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	SENP2	Q9HC62	589 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		27.65	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	SCRN1	Q12765	414 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	CSRNP1	Q96S65	589 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		27.64	■■■□□ 2.02
MTA1-209	ENST00000469140	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	SHMT1	P34896	483 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	RCAN1	P53805	252 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	DGKH	Q86XP1	1220 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		27.63	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	ANKS1A	Q92625	1134 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC17	Q96LX7	622 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	ZBTB43	O43298	467 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	EPS15	P42566	896 aa		27.62	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	NMT2	O60551	498 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	DNAJC18	Q9H819	358 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		27.61	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.6	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	SIPA1L1	O43166	1804 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	RASA3	Q14644	834 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	PPP2R5B	Q15173	497 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	MICU3	Q86XE3	530 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	NID2	Q14112	1375 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MTA1-209	ENST00000469140	TBC1D12	O60347	775 aa		27.57	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	AKR1B1	P15121	316 aa		27.57	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	CALM1	P0DP23	149 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	CALM2	P0DP24	149 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	CALM3	P0DP25	149 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	GJB2	P29033	226 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	NOV	P48745	357 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	GLTPD2	A6NH11	291 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	DDAH1	O94760	285 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	NUCB2	P80303	420 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	MYL10	Q9BUA6	226 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	KAT14	Q9H8E8	782 aa		27.56	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		27.55	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		27.55	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	FAM196B	A6NMK8	535 aa		27.55	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	CPLX1	O14810	134 aa		27.55	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
MTA1-209	ENST00000469140	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2

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