RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.24■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 ZBTB43O43298 467 aa20.24■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.24■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.24■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 CSRNP2Q9H175 543 aa20.24■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 MYO6Q9UM54 1294 aa20.24■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 CTR9Q6PD62 1173 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 GPATCH11Q8N954 259 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 C4AP0C0L4 1744 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 C4BP0C0L5 1744 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 OXER1Q8TDS5 423 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 EPSTI1Q96J88 318 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 DACH1Q9UI36 760 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 MYH8P13535 1937 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 FAM205CA6NFA0 338 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 H7C1W4 665 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 PTPREP23469 700 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 GUCY2CP25092 1073 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 PBX1P40424 430 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 DPYDQ12882 1025 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 PPM1EQ8WY54 764 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 APPBP2Q92624 585 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 CHP1Q99653 195 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 VPS16Q9H269 839 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.23■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.22■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.22■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.22■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.22■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 CDKL5O76039 1030 aa20.22■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.22■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 PPFIA4O75335 1185 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 MMS19Q96T76 1030 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 MYBL2P10244 700 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 LIG3P49916 1009 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 SPATA1Q5VX52 437 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 GGCXP38435 758 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 PIP4K2BP78356 416 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 AMPD2Q01433 879 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.21■□□□□ 0.83
PREB-208ENST00000468045 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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PREB-208ENST00000468045 GPR108Q9NPR9 543 aa20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 CCT5P48643 541 aa20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 GBP3Q9H0R5 595 aa20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 MED4Q9NPJ6 270 aa20.2■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 NBPF26B4DH59 902 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 CUL4BQ13620 913 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 NBPF14Q5TI25 921 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 NBPF15Q8N660 670 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 KAT2BQ92831 832 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 LY9Q9HBG7 655 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 CABP5Q9NP86 173 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 A1BGP04217 495 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.19■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 N4BP3O15049 544 aa20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 KAT14Q9H8E8 782 aa20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 EXOC5O00471 708 aa20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 MMP1P03956 469 aa20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.18■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 USP14P54578 494 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.17■□□□□ 0.82
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