RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 XBP1P17861 261 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 UBE4AQ14139 1066 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.45■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
IMP4-208ENST00000460766 TMEM232C9JQI7 657 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SMARCE1Q969G3 411 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 CSRNP2Q9H175 543 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 KCNJ6P48051 423 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 PPP2R5BQ15173 497 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 ZNF827Q17R98 1081 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 VSTM4Q8IW00 320 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 FAM205CA6NFA0 338 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 USP49Q70CQ1 688 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SHISA4Q96DD7 197 aa23.44■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 MYO1BO43795 1136 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 IQCA1Q86XH1 822 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 PKN1Q16512 942 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 TRIM75PA6NK02 468 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 KRT2P35908 639 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 KCNQ4P56696 695 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 HOMER1Q86YM7 354 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 MLKLQ8NB16 471 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 ZNF384Q8TF68 577 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 DACH1Q9UI36 760 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 KANK3Q6NY19 840 aa23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 CTR9Q6PD62 1173 aa23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 ERO1AQ96HE7 468 aa23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 INTS13Q9NVM9 706 aa23.41■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 USP17L12C9JPN9 530 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 USP17L21D6R901 530 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 FUT2Q10981 343 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 MORC3Q14149 939 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 DHX58Q96C10 678 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 RREB1Q92766 1687 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 KLRK1P26718 216 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SMIM5Q71RC9 77 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 LAMB2P55268 1798 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.39■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.39■■□□□ 1.34
IMP4-208ENST00000460766 TROAPQ12815 778 aa23.39■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CCP110O43303 1012 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 EPSTI1Q96J88 318 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 TMX1Q9H3N1 280 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CALM1P0DP23 149 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CALM2P0DP24 149 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 CALM3P0DP25 149 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-208ENST00000460766 EVX2Q03828 476 aa23.38■■□□□ 1.33
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