RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 ASB11Q8WXH4 323 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.49□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 CTSHP09668 335 aa6.48□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.48□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.48□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 RIN3Q8TB24 985 aa6.48□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 PGRP06401 933 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 JAG1P78504 1218 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 ZP2Q05996 745 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 TMC4Q7Z404 712 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 MFSD4AQ8N468 514 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.47□□□□□ -1.37
TTC3-211ENST00000460328 F6X3S4 739 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 RLBP1P12271 317 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 PHC3Q8NDX5 983 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 USP31Q70CQ4 1352 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CBX7O95931 251 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CDH24Q86UP0 819 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 FAM168AQ92567 244 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CRELD1Q96HD1 420 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.45□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 H3BS24 57 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 PDE4BQ07343 736 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 TMEM87BQ96K49 555 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.44□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 SORBS3O60504 671 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CCDC27Q2M243 656 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 SLC6A19Q695T7 634 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 MRS2Q9HD23 443 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.43□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CYP7A1P22680 504 aa6.42□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 BPNT1O95861 308 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 PF4P02776 101 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 C8AP07357 584 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 KIR3DL1P43629 444 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 LMNB2Q03252 620 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 TNK2Q07912 1038 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 RHOVQ96L33 236 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.41□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 CILPO75339 1184 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 F13A1P00488 732 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 PLCG1P19174 1290 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 UBE2FQ969M7 185 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.4□□□□□ -1.38
TTC3-211ENST00000460328 FAM221AA4D161 298 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC3-211ENST00000460328 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC3-211ENST00000460328 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC3-211ENST00000460328 ERCC3P19447 782 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC3-211ENST00000460328 ETV3P41162 512 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC3-211ENST00000460328 KCNMB1Q16558 191 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC3-211ENST00000460328 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.39□□□□□ -1.39
TTC3-211ENST00000460328 RELL1Q8IUW5 271 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms