RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FSD1Q9BTV5 496 aa13.49□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PICK1Q9NRD5 415 aa13.49□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HELLSQ9NRZ9 838 aa13.49□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MCM9Q9NXL9 1143 aa13.49□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHIPQ8WWQ0 1821 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP17L12C9JPN9 530 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP17L21D6R901 530 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 M0R2C6 588 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCL15Q16663 113 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SH3D19Q5HYK7 790 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPAT2Q6NUI2 795 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTR9Q6PD62 1173 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD23Q86SG2 305 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DOCK1Q14185 1865 aa13.48□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP17L5A8MUK1 530 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BTBD19C9JJ37 291 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FOXP2O15409 715 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ALX1Q15699 326 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERICH6BQ5W0A0 696 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM43AQ8N2R8 423 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SWAP70Q9UH65 585 aa13.47□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C16orf86Q6ZW13 317 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF280CQ8ND82 737 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa13.46□□□□□ -0.25
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ROBO3Q96MS0 1386 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NAV1Q8NEY1 1877 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR25O00155 361 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBC1D8O95759 1140 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP2D6P10635 497 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SDSP20132 328 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GUCY1A2P33402 732 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BACE1P56817 501 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TTC22Q5TAA0 569 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFNL3Q8IZI9 196 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDRGK1Q96HY6 314 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC17Q96LX7 622 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSKSQ9UJT2 592 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HTTP42858 3142 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADGRA2Q96PE1 1338 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C19orf81C9J6K1 198 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM22K7EJ46 135 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FGRP09769 529 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDK8P49336 464 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPP2Q13103 211 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CRHR2Q13324 411 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AS3MTQ9HBK9 375 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTPRFP10586 1907 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZMYM6O95789 1325 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A0D9SFI3 127 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP17L10C9JJH3 530 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIP1O00291 1037 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TLR2O60603 784 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GH2P01242 217 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ABCB5Q2M3G0 1257 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C17orf99Q6UX52 265 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SIAH1Q8IUQ4 282 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DYNLL2Q96FJ2 89 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C12orf42Q96LP6 360 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM227BQ96M60 508 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NACAP1Q9BZK3 213 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANAPC4Q9UJX5 808 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATAD5Q96QE3 1844 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM75PA6NK02 468 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDHXO00330 501 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM179Q6ZVK1 233 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AMOTL1Q8IY63 956 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa13.42□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa13.41□□□□□ -0.26
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FKTNO75072 461 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms