RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARMT1Q9H993 441 aa17.52■□□□□ 0.39
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MTMR2Q13614 643 aa17.51■□□□□ 0.39
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GRK4P32298 578 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L2Q6R6M4 530 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPATCH3Q96I76 525 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C12orf42Q96LP6 360 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A0G2JMZ2 1700 aa17.41■□□□□ 0.38
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L12C9JPN9 530 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USP17L21D6R901 530 aa17.4■□□□□ 0.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 M0R2C6 588 aa17.4■□□□□ 0.38
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