RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 FUT2Q10981 343 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 SBF2Q86WG5 1849 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 MECOMQ03112 1051 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 ISM2Q6H9L7 571 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 CNNM3Q8NE01 707 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 OXER1Q8TDS5 423 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 IFNKQ9P0W0 207 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 SKILP12757 684 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 GRIN1Q05586 938 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 PKN1Q16512 942 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 LY75O60449 1722 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 SMC2O95347 1197 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 IQCA1Q86XH1 822 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 USP17L12C9JPN9 530 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 USP17L21D6R901 530 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 ZBTB22O15209 634 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 GNPATO15228 680 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 PRDM1O75626 825 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 TROAPQ12815 778 aa20.48■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 ORC4O43929 436 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 ZPR1O75312 459 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 TNNT1P13805 278 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 SPECC1Q5M775 1068 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 TSC1Q92574 1164 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 DDAH1O94760 285 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 CALM1P0DP23 149 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 CALM2P0DP24 149 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 CALM3P0DP25 149 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 XBP1P17861 261 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 MYL5Q02045 173 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 KCND1Q9NSA2 647 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 PRDX5P30044 214 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 FANCCQ00597 558 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 CABP5Q9NP86 173 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 FOXN1O15353 648 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 TM4SF1P30408 202 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 EVX2Q03828 476 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 TMC6Q7Z403 805 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.46■□□□□ 0.87
CLDN9-201ENST00000445369 USP27XA6NNY8 438 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.45■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 ATP1A3P13637 1013 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 BMP6P22004 513 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 KRT2P35908 639 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 POSTNQ15063 836 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 OLFM4Q6UX06 510 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 USP21Q9UK80 565 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 FAM205CA6NFA0 338 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 SBK1Q52WX2 424 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CLDN9-201ENST00000445369 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms