RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 SERPINB13Q9UIV8 391 aa18.4■□□□□ 0.54
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HERC3-206ENST00000431413 PHIPQ8WWQ0 1821 aa18.39■□□□□ 0.54
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HERC3-206ENST00000431413 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
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HERC3-206ENST00000431413 EMILIN3Q9NT22 766 aa18.32■□□□□ 0.52
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HERC3-206ENST00000431413 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.31■□□□□ 0.52
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HERC3-206ENST00000431413 AMOTL1Q8IY63 956 aa18.31■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.31■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 C12orf42Q96LP6 360 aa18.31■□□□□ 0.52
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HERC3-206ENST00000431413 USP17L18D6R9N7 530 aa18.3■□□□□ 0.52
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HERC3-206ENST00000431413 USP17L24Q0WX57 530 aa18.3■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
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HERC3-206ENST00000431413 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa18.3■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 BRCA2P51587 3418 aa18.3■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 TFRCP02786 760 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
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