RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 KDM4AO75164 1064 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 HSPA6P17066 643 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 NEK1Q96PY6 1258 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 TSPY2A6NKD2 308 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 PSMA5P28066 241 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 WRNIP1Q96S55 665 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 GDF11O95390 407 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 TSPY3P0CV98 308 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 TSPY8P0CW00 308 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 MYH4Q9Y623 1939 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 AKR1B1P15121 316 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 TFAP4Q01664 338 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC17Q96LX7 622 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 NT5C2P49902 561 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 KLRG1Q96E93 195 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 IL17RAQ96F46 866 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 CPA1P15085 419 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 INPP5BP32019 993 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 MCM5P33992 734 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 CAP2P40123 477 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 CHST3Q7LGC8 479 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 KIF2CQ99661 725 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 CABP5Q9NP86 173 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 PASKQ96RG2 1323 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 GH2P01242 217 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 MOB2Q70IA6 237 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 IQCA1Q86XH1 822 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 APLP1P51693 650 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.29■■□□□ 1.48
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HOXA4-202ENST00000428284 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 PRC1O43663 620 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 RPS6KB1P23443 525 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K9P80192 1104 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 RUFY3Q7L099 469 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 CSADQ9Y600 493 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 ASNSP08243 561 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 ANTXR2P58335 489 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 FKBP1BP68106 108 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 JAG1P78504 1218 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K11Q16584 847 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXA4-202ENST00000428284 NMT2O60551 498 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 CST9Q5W186 159 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 PICK1Q9NRD5 415 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 CEP350Q5VT06 3117 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.25■■□□□ 1.47
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HOXA4-202ENST00000428284 SEPT2Q15019 361 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 RABEP1Q15276 862 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 TNKSO95271 1327 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 ERICH2A1L162 156 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXA4-202ENST00000428284 NEK4P51957 841 aa24.25■■□□□ 1.47
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