RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
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PTPRU-204ENST00000428026 ARHGAP25P42331 645 aa16.17■□□□□ 0.18
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PTPRU-204ENST00000428026 FAM169AQ9Y6X4 670 aa16.15■□□□□ 0.18
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PTPRU-204ENST00000428026 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.14■□□□□ 0.17
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PTPRU-204ENST00000428026 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.14■□□□□ 0.17
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PTPRU-204ENST00000428026 TNFAIP3P21580 790 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TIMM10P62072 90 aa16.14■□□□□ 0.17
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PTPRU-204ENST00000428026 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 MLKLQ8NB16 471 aa16.13■□□□□ 0.17
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PTPRU-204ENST00000428026 SGSM2O43147 1006 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TAF5LO75529 589 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PSMD6Q15008 389 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC110Q8TBZ0 833 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PAK2Q13177 524 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PNOCQ13519 176 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
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