RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 IRF5Q13568 498 aa25.35■■□□□ 1.65
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UBXN4-204ENST00000426921 EHD4Q9H223 541 aa25.35■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 MYH1P12882 1939 aa25.35■■□□□ 1.65
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UBXN4-204ENST00000426921 MTMR2Q13614 643 aa25.34■■□□□ 1.65
UBXN4-204ENST00000426921 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
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UBXN4-204ENST00000426921 C19orf81C9J6K1 198 aa25.32■■□□□ 1.64
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UBXN4-204ENST00000426921 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.32■■□□□ 1.64
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UBXN4-204ENST00000426921 COA7Q96BR5 231 aa25.31■■□□□ 1.64
UBXN4-204ENST00000426921 GCC1Q96CN9 775 aa25.31■■□□□ 1.64
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UBXN4-204ENST00000426921 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.31■■□□□ 1.64
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UBXN4-204ENST00000426921 GH2P01242 217 aa25.28■■□□□ 1.64
UBXN4-204ENST00000426921 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
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UBXN4-204ENST00000426921 RNF208Q9H0X6 261 aa25.28■■□□□ 1.64
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UBXN4-204ENST00000426921 ELNP15502 786 aa25.27■■□□□ 1.64
UBXN4-204ENST00000426921 C12orf42Q96LP6 360 aa25.27■■□□□ 1.64
UBXN4-204ENST00000426921 HERVK_113P62684 666 aa25.26■■□□□ 1.63
UBXN4-204ENST00000426921 GABPAQ06546 454 aa25.26■■□□□ 1.63
UBXN4-204ENST00000426921 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.26■■□□□ 1.63
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UBXN4-204ENST00000426921 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.26■■□□□ 1.63
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UBXN4-204ENST00000426921 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.22■■□□□ 1.63
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UBXN4-204ENST00000426921 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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UBXN4-204ENST00000426921 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.2■■□□□ 1.62
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UBXN4-204ENST00000426921 CABP5Q9NP86 173 aa25.2■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 GUCY1A2P33402 732 aa25.19■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 ERVK-9P63128 1117 aa25.19■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 ERVK-24P63145 666 aa25.19■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.19■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.19■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 PEX10O60683 326 aa25.18■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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