RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP4CP60510 307 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM32Q13049 653 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBNDD2Q9BQY9 259 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPTORQ8N122 1335 aa16.15■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JAG1P78504 1218 aa16.15■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLA2Q14181 598 aa16.15■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIB2Q92519 343 aa16.15■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM34Q9BYJ4 488 aa16.15■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDF11O95390 407 aa16.14■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HERVK_113P62684 666 aa16.14■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.14■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GINM1Q9NU53 330 aa16.14■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa16.14■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf81C9J6K1 198 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP17L10C9JJH3 530 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGSF3O75054 1194 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP2B6P20813 491 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSH3Q8TE77 659 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOCS4Q8WXH5 440 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXNRD2Q9NNW7 524 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAP2Q9UGK3 403 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PALD1Q9ULE6 856 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYH1P12882 1939 aa16.13■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEX10O60683 326 aa16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DOAP06340 250 aa16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZAP70P43403 619 aa16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBPF3Q9H094 633 aa16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.11■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OGDHLQ9ULD0 1010 aa16.11■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK4P31152 587 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVK-9P63128 1117 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVK-24P63145 666 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP8B2P98198 1209 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDE3AQ14432 1141 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRCH3Q96II8 777 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDF15Q99988 308 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBPJLQ9UBG7 517 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMILIN3Q9NT22 766 aa16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.09■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP7A1P22680 504 aa16.09■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMP8BP34820 402 aa16.09■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS2P41220 211 aa16.09■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP17L2Q6R6M4 530 aa16.09■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR142Q7Z601 462 aa16.09■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP6NLQ92738 828 aa16.09■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PORCNQ9H237 461 aa16.09■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PFASO15067 1338 aa16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IDH1O75874 414 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GH2P01242 217 aa16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q3C1V9 767 aa16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CERS3Q8IU89 383 aa16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf42Q96LP6 360 aa16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APBA2Q99767 749 aa16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF39Q9H2S5 420 aa16.08■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL6A3P12111 3177 aa16.07■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAV1Q8NEY1 1877 aa16.07■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYN1P17600 705 aa16.07■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP5P45974 858 aa16.07■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MORN1Q5T089 497 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms