RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 ITFG2Q969R8 447 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 HYOU1Q9Y4L1 999 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 PTPRKQ15262 1439 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 AFMP43652 599 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 GUCY2FP51841 1108 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 STOML1Q9UBI4 398 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 TXNDC9O14530 226 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 PFKFB2O60825 505 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 RPS6KA5O75582 802 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 PAX7P23759 505 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 PLA2G4AP47712 749 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 LCA5Q86VQ0 697 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 TBC1D5Q92609 795 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.16□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 PALMDQ9NP74 551 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MTMR6Q9Y217 621 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 GRIN2BQ13224 1484 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF213O14771 459 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 STX2P32856 288 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 C3orf20Q8ND61 904 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 COG1Q8WTW3 980 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 NUF2Q9BZD4 464 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 A0A0G2JS52 829 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 GSTA2P09210 222 aa7.15□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 RNF14Q9UBS8 474 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 NCOA7Q8NI08 942 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MORC4Q8TE76 937 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 SLC35F6Q8N357 371 aa7.15□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 VCPKMTQ9H867 229 aa7.15□□□□□ -1.26
SBNO1-202ENST00000420886 MBIPQ9NS73 344 aa7.15□□□□□ -1.26
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SBNO1-202ENST00000420886 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.15□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.15□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.15□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 HHATQ5VTY9 493 aa7.15□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 STRN4Q9NRL3 753 aa7.15□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 CUTAO60888 179 aa7.15□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.15□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 PHBP35232 272 aa7.14□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
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SBNO1-202ENST00000420886 NLRP1Q9C000 1473 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 VWA3BQ502W6 1294 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 CALML4Q96GE6 196 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.14□□□□□ -1.27
SBNO1-202ENST00000420886 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.14□□□□□ -1.27
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