RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414510.5

PTPA-210, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPA, Length 1,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-210ENST00000414510 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa29.3■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 USP17L5A8MUK1 530 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 SHMT1P34896 483 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 GABPAQ06546 454 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 PDHXO00330 501 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 GPAA1O43292 621 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 SPP2Q13103 211 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 DYNLL2Q96FJ2 89 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 GH2P01242 217 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 ASNSP08243 561 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 ZNF280CQ8ND82 737 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 EVI5LQ96CN4 794 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPA-210ENST00000414510 USP17L12C9JPN9 530 aa29.26■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 USP17L21D6R901 530 aa29.26■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa29.26■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 GSG1L2A8MUP6 293 aa29.25■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 AS3MTQ9HBK9 375 aa29.25■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 HMGCS2P54868 508 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 IFFO2Q5TF58 517 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 C12orf60Q5U649 245 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 CTR9Q6PD62 1173 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 CD99L2Q8TCZ2 262 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 PDE4AP27815 886 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 CAP1Q01518 475 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 MTMR2Q13614 643 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 ABCB5Q2M3G0 1257 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 TREML2Q5T2D2 321 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 ADGRA2Q96PE1 1338 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 TLR2O60603 784 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 CAPN15O75808 1086 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 CYP2C8P10632 490 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 ABHD8Q96I13 439 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 WDR18Q9BV38 432 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 OSBPL3Q9H4L5 887 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 GINM1Q9NU53 330 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 SP3Q02447 781 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 AMOTL1Q8IY63 956 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 RILPL2Q969X0 211 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 CPA4Q9UI42 421 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPA-210ENST00000414510 GUCY1A2P33402 732 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 GNAT2P19087 354 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 SWAP70Q9UH65 585 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 APPP05067 770 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 CDK8P49336 464 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 BACE1P56817 501 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 SEPT2Q15019 361 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 C16orf86Q6ZW13 317 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 ERO1AQ96HE7 468 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 FAM227BQ96M60 508 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 CABP5Q9NP86 173 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 A0A0D9SFI3 127 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 TDO2P48775 406 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 GIMAP6Q6P9H5 292 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 C17orf99Q6UX52 265 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 TRIM17Q9Y577 477 aa29.17■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 USP17L10C9JJH3 530 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 AKR1B1P15121 316 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 SBK1Q52WX2 424 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 FOXP2O15409 715 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 IFNL3Q8IZI9 196 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 ACER1Q8TDN7 264 aa29.15■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.14■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 FEZ1Q99689 392 aa29.14■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 TMOD4Q9NZQ9 345 aa29.14■■■□□ 2.26
PTPA-210ENST00000414510 C19orf81C9J6K1 198 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 VPS53Q5VIR6 699 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 HELLSQ9NRZ9 838 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPA-210ENST00000414510 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms