RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 PNKPQ96T60 521 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.42■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 GPS2Q13227 327 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 LRP6O75581 1613 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM205CA6NFA0 338 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ABL1P00519 1130 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 AFMP43652 599 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 BRD3Q15059 726 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ZSCAN26Q16670 478 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.41■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 GPTP24298 496 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 LMAN1P49257 510 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 MCM6Q14566 821 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 WASF1Q92558 559 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 NAPBQ9H115 298 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CDC23Q9UJX2 597 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 RTN1Q16799 776 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 EPSTI1Q96J88 318 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CABP5Q9NP86 173 aa21.4■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.39■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.39■■□□□ 1.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 COBLO75128 1261 aa21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PBX1P40424 430 aa21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ARMT1Q9H993 441 aa21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 MBD4O95243 580 aa21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 SHISA4Q96DD7 197 aa21.39■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PRKAB2O43741 272 aa21.38■■□□□ 1.01
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NEFHP1-201ENST00000412845 CASP14P31944 242 aa21.38■■□□□ 1.01
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NEFHP1-201ENST00000412845 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TOMM22Q9NS69 142 aa21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 MYH6P13533 1939 aa21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 EXOC4Q96A65 974 aa21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 STRN4Q9NRL3 753 aa21.38■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 MFAP3LO75121 409 aa21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 KANK3Q6NY19 840 aa21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC35F6Q8N357 371 aa21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 HLFQ16534 295 aa21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ABCB6Q9NP58 842 aa21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 RAB21Q9UL25 225 aa21.37■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PDE8BO95263 885 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 GYPCP04921 128 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PAPPAQ13219 1627 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 SNAP23O00161 211 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 DEXIO95424 95 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 WTAPQ15007 396 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.36■■□□□ 1.01
NEFHP1-201ENST00000412845 CEP112Q8N8E3 955 aa21.36■■□□□ 1.01
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