RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	PDC	P20941	246 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	RASA1	P20936	1047 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	PHKB	Q93100	1093 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	SYT17	Q9BSW7	474 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300		H3BQV1	296 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RAD9B-204	ENST00000409300	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TNIP1	Q15025	636 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	F13A1	P00488	732 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	RTN1	Q16799	776 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	PSME4	Q14997	1843 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	GABPA	Q06546	454 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CDKL5	O76039	1030 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TROAP	Q12815	778 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	NTRK3	Q16288	839 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	EGFR	P00533	1210 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	FZD9	O00144	591 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	WNT10B	O00744	389 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	MYO1B	O43795	1136 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	AKR1B1	P15121	316 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	SHMT1	P34896	483 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31

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