RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 TREML2Q5T2D2 321 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 OSBP2Q969R2 916 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 FSD1Q9BTV5 496 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SMIM22K7EJ46 135 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 MTMR2Q13614 643 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SHMT1P34896 483 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SMC5Q8IY18 1101 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 APPBP2Q92624 585 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 EFCC1Q9HA90 598 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 PDE1AP54750 535 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 C17orf99Q6UX52 265 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 WDR18Q9BV38 432 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 USP17L12C9JPN9 530 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 USP17L21D6R901 530 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 M0R2C6 588 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 GABPAQ06546 454 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 STAP2Q9UGK3 403 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRN2-204ENST00000404321 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 MYH1P12882 1939 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 GPAA1O43292 621 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 BACE1P56817 501 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 GINM1Q9NU53 330 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 USP17L10C9JJH3 530 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 NUCB1Q02818 461 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 KIF22Q14807 665 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 C12orf60Q5U649 245 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CTR9Q6PD62 1173 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CABP5Q9NP86 173 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CTGFP29279 349 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SEPT2Q15019 361 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 FEZ1Q99689 392 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 APPP05067 770 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 GUCY1A2P33402 732 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ACER1Q8TDN7 264 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 C19orf81C9J6K1 198 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 BCRP11274 1271 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 PSMC4P43686 418 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SOX10P56693 466 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ARHGEF6Q15052 776 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 EVI5LQ96CN4 794 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SWAP70Q9UH65 585 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 PNMA3Q9UL41 463 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 AKR1B1P15121 316 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 TDO2P48775 406 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CDK8P49336 464 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM47Q96LD4 638 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-204ENST00000404321 MYH7P12883 1935 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRN2-204ENST00000404321 OSBPP22059 807 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN2-204ENST00000404321 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
PTPRN2-204ENST00000404321 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1162.4 ms