RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 PDE6AP16499 860 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 ABCA6Q8N139 1617 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP6R2O75170 966 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC121Q6ZUS5 278 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT13P13646 458 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 STAMQ92783 540 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA6CA6NDK9 693 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 BTBD18B2RXH4 712 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP2C2O75185 946 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA6DP0CG33 693 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 HOOK3Q86VS8 718 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC65Q8IXS2 484 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 GPATCH11Q8N954 259 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC14Q96N46 770 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 OR8K1Q8NGG5 319 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 CLIC6Q96NY7 704 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 MAST3O60307 1309 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 CIAO1O76071 339 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF827Q17R98 1081 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 FANCBQ8NB91 859 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 VWA3BQ502W6 1294 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA1Q5VX52 437 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE3CQ15386 1083 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 ZSCAN26Q16670 478 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 LONRF3Q496Y0 759 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKS4BQ8N8V4 417 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 RABGGTAQ92696 567 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA6BA6NDN3 693 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEA1P43355 309 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC174Q6PII3 467 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 SARM1Q6SZW1 724 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX12PQ92771 950 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 IQCDQ96DY2 449 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 NOX5Q96PH1 765 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 SAR1BQ9Y6B6 198 aa18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP8B1O43520 1251 aa18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 PPARAQ07869 468 aa18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 MED23Q9ULK4 1368 aa18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL13P26373 211 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 BLZF1Q9H2G9 400 aa18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 CTSWP56202 376 aa18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 REREQ9P2R6 1566 aa18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 NDUFAB1O14561 156 aa18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 APOA5Q6Q788 366 aa18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT25Q7Z3Z0 450 aa18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 CPLX4Q7Z7G2 160 aa18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGEF25Q86VW2 580 aa18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 FMNL3Q8IVF7 1028 aa18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 IFT20Q8IY31 132 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 SAMM50Q9Y512 469 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 CTNNA2P26232 953 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 USP37Q86T82 979 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 SPDYE3A6NKU9 549 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 ST5P78524 1137 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 PICALMQ13492 652 aa18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 NLRP1Q9C000 1473 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 PPFIA1Q13136 1202 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 E9PCH4 1651 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 HAUS4Q9H6D7 363 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 ADGRB3O60242 1522 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNJ18B7U540 433 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNJ12Q14500 433 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 NBPF14Q5TI25 921 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC77Q9BR77 488 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A087WWV3 80 aa18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2-201ENST00000398073 TICAM2Q86XR7 235 aa18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms