RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MFSD4AQ8N468 514 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OXR1Q8N573 874 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PMEPA1Q969W9 287 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SHISA4Q96DD7 197 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UCN2Q96RP3 112 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EREGO14944 169 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZBTB39O15060 712 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 B3GALT4O96024 378 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 EDN3P14138 238 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VIPR1P32241 457 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GALK1P51570 392 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDR1P51861 262 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FGD1P98174 961 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CAP1Q01518 475 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLCB3Q01970 1234 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PTK7Q13308 1070 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FHL2Q14192 279 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SNX17Q15036 470 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C16orf46Q6P387 395 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGDCC3Q8IVU1 814 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RNF214Q8ND24 703 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MZB1Q8WU39 189 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CHFRQ96EP1 664 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LATS2Q9NRM7 1088 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZSWIM5Q9P217 1185 aa1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A1W2PP55 124 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ITGB6P18564 788 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GRIA4P48058 902 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AP3B2Q13367 1082 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPRED3Q2MJR0 410 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SFRP5Q5T4F7 317 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADGRF1Q5T601 910 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DNAJC10Q8IXB1 793 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CHST13Q8NET6 341 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPATA25Q9BR10 227 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GGNBP2Q9H3C7 697 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GPR160Q9UJ42 338 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A1B0GTL3 188 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A6NHS1 94 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NOBOXO60393 691 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ERBB2P04626 1255 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NTF4P34130 210 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 YBX1P67809 324 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VWA3BQ502W6 1294 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LCE1EQ5T753 118 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LIPIQ6XZB0 460 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBE3DQ7Z6J8 389 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LDHDQ86WU2 507 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CREG2Q8IUH2 290 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCNJLQ8IV13 435 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ANKMY2Q8IV38 441 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CEP89Q96ST8 783 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LNPKQ9C0E8 428 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IKZF4Q9H2S9 585 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRT82Q9NSB4 513 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WASH4PA8MWX3 477 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L15C9J2P7 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L10C9JJH3 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L13C9JLJ4 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L12C9JPN9 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L11C9JVI0 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L21D6R901 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L18D6R9N7 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L22D6RA61 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L17D6RBQ6 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L19D6RCP7 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L20D6RJB6 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PPFIA2O75334 1257 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLITRK5O94991 958 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ERVK-24P63145 666 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TNK2Q07912 1038 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 USP17L24Q0WX57 530 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPPL2CQ8IUH8 684 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SIRT2Q8IXJ6 389 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IL27Q8NEV9 243 aa1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms