RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.49■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 NBPF11Q86T75 865 aa28.48■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.48■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 HAUS7Q99871 368 aa28.48■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa28.48■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 MYH7P12883 1935 aa28.47■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 GINM1Q9NU53 330 aa28.47■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 CENPFP49454 3210 aa28.47■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 HOXD10P28358 340 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 FCGRTP55899 365 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 MTMR2Q13614 643 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 TTC6Q86TZ1 520 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 EHD4Q9H223 541 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 PNMA3Q9UL41 463 aa28.46■■■□□ 2.15
FAAP20-201ENST00000378543 PLCD1P51178 756 aa28.45■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 BACE1P56817 501 aa28.45■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 TATDN1Q6P1N9 297 aa28.45■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 LCORLQ8N3X6 602 aa28.45■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 MYPNQ86TC9 1320 aa28.44■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 ADD2P35612 726 aa28.44■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa28.44■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 MYCP01106 439 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 GH2P01242 217 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 CHGBP05060 677 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.142e-7■■■□□ 17.4
FAAP20-201ENST00000378543 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.43■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L10C9JJH3 530 aa28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 EN2P19622 333 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 PRKCZQ05513 592 aa28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 RAET1EQ8TD07 263 aa28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 ARMT1Q9H993 441 aa28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 TMOD4Q9NZQ9 345 aa28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 GABRQQ9UN88 632 aa28.42■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 C19orf81C9J6K1 198 aa28.41■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 EVX2Q03828 476 aa28.41■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.41■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 SHMT1P34896 483 aa28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 FAM110CQ1W6H9 321 aa28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 CRBNQ96SW2 442 aa28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.4■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 MBD4O95243 580 aa28.39■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 GABPAQ06546 454 aa28.39■■■□□ 2.14
FAAP20-201ENST00000378543 PRKAB2O43741 272 aa28.38■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 GRK4P32298 578 aa28.38■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 GPATCH3Q96I76 525 aa28.38■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 CYP2D6P10635 497 aa28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 UBE3CQ15386 1083 aa28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 EMILIN3Q9NT22 766 aa28.37■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.36■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 MTFR1Q15390 333 aa28.36■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.36■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 FLT3LGP49771 235 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 USP17L2Q6R6M4 530 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 CABP5Q9NP86 173 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 MYH8P13535 1937 aa28.35■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 GUCY1A2P33402 732 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.34■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 BRCA2P51587 3418 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 SLAIN1Q8ND83 568 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 ACER1Q8TDN7 264 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 COA7Q96BR5 231 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 GCC1Q96CN9 775 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 FEZ1Q99689 392 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 MORF4L1Q9UBU8 362 aa28.33■■■□□ 2.13
FAAP20-201ENST00000378543 PEX10O60683 326 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 HERVK_113P62684 666 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 DYNLL2Q96FJ2 89 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 C12orf42Q96LP6 360 aa28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 ADCY3O60266 1144 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 IRF5Q13568 498 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 SEPT2Q15019 361 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 SMIM22K7EJ46 135 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-201ENST00000378543 ELNP15502 786 aa28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms