RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 WRNIP1Q96S55 665 aa27.88■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 GDF11O95390 407 aa27.86■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 AKR1B1P15121 316 aa27.86■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 MAP3K11Q16584 847 aa27.86■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 FAM47AQ5JRC9 791 aa27.86■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.86■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.86■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 CAP2P40123 477 aa27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 IL17RAQ96F46 866 aa27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 KRT23Q9C075 422 aa27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 KDM4AO75164 1064 aa27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 IREB2P48200 963 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 ANAPC15P60006 121 aa27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 KRT32Q14532 448 aa27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 NCOA7Q8NI08 942 aa27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 TFAP4Q01664 338 aa27.84■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 TRDNQ13061 729 aa27.84■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 ARMC9Q7Z3E5 817 aa27.84■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 ZSWIM5Q9P217 1185 aa27.84■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.83■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.83■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.83■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 ESR2Q92731 530 aa27.83■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC17Q96LX7 622 aa27.83■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 NEK1Q96PY6 1258 aa27.83■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 KIF2CQ99661 725 aa27.83■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
PDSS1-201ENST00000376215 GH2P01242 217 aa27.82■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 GUCY1A2P33402 732 aa27.82■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 FKBP1BP68106 108 aa27.82■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 MAP3K9P80192 1104 aa27.82■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 PLIN4Q96Q06 1357 aa27.82■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 PHIPQ8WWQ0 1821 aa27.82■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 TSPY2A6NKD2 308 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 VGLL4Q14135 290 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 TSPY3P0CV98 308 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 TSPY8P0CW00 308 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 CPA1P15085 419 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 ANTXR2P58335 489 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 SCYL3Q8IZE3 742 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 NEDD1Q8NHV4 660 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 CLMNQ96JQ2 1002 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 NMT2O60551 498 aa27.8■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 CHST3Q7LGC8 479 aa27.8■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 IL17RBQ9NRM6 502 aa27.8■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa27.8■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 CASTP20810 708 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 CLEC10AQ8IUN9 316 aa27.79■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa27.79■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.79■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 MYH4Q9Y623 1939 aa27.79■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 NT5C2P49902 561 aa27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 SEPT2Q15019 361 aa27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM179Q6ZVK1 233 aa27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 ASNSP08243 561 aa27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 PSMA5P28066 241 aa27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 CABP5Q9NP86 173 aa27.78■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 MCM5P33992 734 aa27.77■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.77■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 TCEANC2Q96MN5 208 aa27.77■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 CSADQ9Y600 493 aa27.77■■■□□ 2.04
PDSS1-201ENST00000376215 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.76■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 CEP95Q96GE4 821 aa27.76■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 GINM1Q9NU53 330 aa27.76■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa27.76■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 PRC1O43663 620 aa27.75■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 PTPRAP18433 802 aa27.75■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 RUFY3Q7L099 469 aa27.75■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.75■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 ELP3Q9H9T3 547 aa27.75■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 PICK1Q9NRD5 415 aa27.75■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
PDSS1-201ENST00000376215 UNCXA6NJT0 531 aa27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms