RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375429.7

NELFE-202, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFE, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-202ENST00000375429 ESR2Q92731 530 aa24.39■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.39■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.39■■□□□ 1.5
NELFE-202ENST00000375429 AKR1B1P15121 316 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 PSMA5P28066 241 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 JAG1P78504 1218 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 TFAP4Q01664 338 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 CHST3Q7LGC8 479 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 KLRG1Q96E93 195 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 CCDC17Q96LX7 622 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 TSPY2A6NKD2 308 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 GDF11O95390 407 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 MOB2Q70IA6 237 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.36■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 INPP5BP32019 993 aa24.36■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 CAP2P40123 477 aa24.36■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 ANTXR2P58335 489 aa24.36■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.36■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.36■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 WRNIP1Q96S55 665 aa24.36■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 TSPY3P0CV98 308 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 TSPY8P0CW00 308 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 RUFY3Q7L099 469 aa24.35■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 PASKQ96RG2 1323 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 RPS6KB1P23443 525 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 MCM5P33992 734 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 NT5C2P49902 561 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 CST9Q5W186 159 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.498e-8■□□□□ 9.6
NELFE-202ENST00000375429 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.34■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 PRC1O43663 620 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 NMT2O60551 498 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 GH2P01242 217 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 MAP3K11Q16584 847 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.33■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
NELFE-202ENST00000375429 GUCY1A2P33402 732 aa24.33■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 MAP3K9P80192 1104 aa24.33■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.33■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 SEPT2Q15019 361 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 CABP5Q9NP86 173 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 OTOFQ9HC10 1997 aa24.32■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 NEK4P51957 841 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 IQCA1Q86XH1 822 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 DOCK1Q14185 1865 aa24.31■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 FSTL1Q12841 308 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 RABEP1Q15276 862 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.3■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 ASNSP08243 561 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 FKBP1BP68106 108 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 CEP95Q96GE4 821 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 VGLL4Q14135 290 aa24.29■■□□□ 1.48
NELFE-202ENST00000375429 SEC23AQ15436 765 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms