RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 DCTPP1Q9H773 170 aa9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-201ENST00000361543 CPA4Q9UI42 421 aa9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-201ENST00000361543 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-201ENST00000361543 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-201ENST00000361543 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.27□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 USP17L5A8MUK1 530 aa9.27□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 GDF11O95390 407 aa9.27□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 ASNSP08243 561 aa9.27□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 CYP2C8P10632 490 aa9.27□□□□□ -0.93
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SGMS1-201ENST00000361543 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
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SGMS1-201ENST00000361543 HOXD10P28358 340 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 PRKCZQ05513 592 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 GABPAQ06546 454 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.22□□□□□ -0.93
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