RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 KIF28PB7ZC32 967 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ST18O60284 1047 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP1BP68106 108 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 NUCB1Q02818 461 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 MTMR2Q13614 643 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 RASGRF1Q13972 1273 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 HSCBQ8IWL3 235 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 HMG20BQ9P0W2 317 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ABCC12Q96J65 1359 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PDHXO00330 501 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PPFIA3O75145 1194 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 FCER1AP12319 257 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PDE6AP16499 860 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP5P59047 1200 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 DRC1Q96MC2 740 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 KDM3BQ7LBC6 1761 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SPDYE2BA6NHP3 402 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 GPAA1O43292 621 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ADCY3O60266 1144 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SPDYE6P0CI01 402 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 RAG1P15918 1043 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 KRT23Q9C075 422 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SHTN1A0MZ66 631 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L15C9J2P7 530 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L11C9JVI0 530 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L18D6R9N7 530 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L22D6RA61 530 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L17D6RBQ6 530 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L19D6RCP7 530 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L20D6RJB6 530 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 GPR25O00155 361 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PDE4AP27815 886 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L24Q0WX57 530 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SEPT2Q15019 361 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L2Q6R6M4 530 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF710Q8N1W2 664 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB118Q96PH6 123 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 AZI2Q9H6S1 392 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 COPRSQ9NQ92 184 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 PES1O00541 588 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 KLRK1P26718 216 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 GNAQP50148 359 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 APPBP2Q92624 585 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 KCPQ6ZWJ8 1503 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 GLI3P10071 1580 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8AA7E2F4 631 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8BA8MQT2 603 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CDC45O75419 566 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 MYL3P08590 195 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2C8P10632 490 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF16Q5VV41 709 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 NCOA7Q8NI08 942 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 NKX2-3Q8TAU0 364 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SSH3Q8TE77 659 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 GLT1D1Q96MS3 346 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 UIMC1Q96RL1 719 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 TCHPQ9BT92 498 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 VIL1P09327 827 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CALM1P0DP23 149 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CALM2P0DP24 149 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CALM3P0DP25 149 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 STAT3P40763 770 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 NAPAP54920 295 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 SEPT14Q6ZU15 432 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 PXDNLA1KZ92 1463 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 RARBP10826 455 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 TAF12Q16514 161 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-201ENST00000348564 DYNLL2Q96FJ2 89 aa5.14□□□□□ -1.59
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