RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP2D6P10635 497 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAP1Q01518 475 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABPAQ06546 454 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPP2Q13103 211 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 GINM1Q9NU53 330 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAP2Q9UGK3 403 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYH8P13535 1937 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHMT1P34896 483 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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PTPRCAP-201ENST00000326294 OSBP2Q969R2 916 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 LNPKQ9C0E8 428 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE1AP54750 535 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR18Q9BV38 432 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.54■■□□□ 1.36
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PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP2C8P10632 490 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGCS2P54868 508 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 TREML2Q5T2D2 321 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 C17orf99Q6UX52 265 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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PTPRCAP-201ENST00000326294 FSD1Q9BTV5 496 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPA4Q9UI42 421 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM17Q9Y577 477 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R2C6 588 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTMR2Q13614 643 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUCB1Q02818 461 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM22K7EJ46 135 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPAA1O43292 621 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 BACE1P56817 501 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf60Q5U649 245 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTTP42858 3142 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP17L12C9JPN9 530 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP17L21D6R901 530 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCRP11274 1271 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFCC1Q9HA90 598 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 GUCY1A2P33402 732 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTR9Q6PD62 1173 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SWAP70Q9UH65 585 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP17L10C9JJH3 530 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 EVI5LQ96CN4 794 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGAMO43451 1857 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 C19orf81C9J6K1 198 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTGFP29279 349 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 CABP5Q9NP86 173 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNMA3Q9UL41 463 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.45■■□□□ 1.34
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNAT2P19087 354 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK8P49336 464 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF22Q14807 665 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEPT2Q15019 361 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 SBK1Q52WX2 424 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKR1B1P15121 316 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF6Q15052 776 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACER1Q8TDN7 264 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf42Q96LP6 360 aa23.43■■□□□ 1.34
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