RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 CHGBP05060 677 aa20.38■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 CTGFP29279 349 aa20.38■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 USP5P45974 858 aa20.38■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 GTF2A2P52657 109 aa20.38■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.38■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.38■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.38■□□□□ 0.85
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SFTPC-201ENST00000318561 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 LCORLQ8N3X6 602 aa20.37■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 APPBP2Q92624 585 aa20.37■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 SRRDQ9UH36 339 aa20.37■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 GDF15Q99988 308 aa20.36■□□□□ 0.85
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SFTPC-201ENST00000318561 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.35■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 RAET1EQ8TD07 263 aa20.35■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 RILPL2Q969X0 211 aa20.35■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 TRIM47Q96LD4 638 aa20.35■□□□□ 0.85
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SFTPC-201ENST00000318561 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.35■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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SFTPC-201ENST00000318561 BMP8BP34820 402 aa20.34■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 PSMC4P43686 418 aa20.34■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 TICAM2Q86XR7 235 aa20.34■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 OSBP2Q969R2 916 aa20.34■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.34■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 SIPA1L1O43166 1804 aa20.34■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 VCANP13611 3396 aa20.34■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 MAP3K9P80192 1104 aa20.33■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 VGLL4Q14135 290 aa20.33■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 TTC22Q5TAA0 569 aa20.33■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 WRNIP1Q96S55 665 aa20.33■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SFTPC-201ENST00000318561 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 BTBD19C9JJ37 291 aa20.32■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 HLA-DOAP06340 250 aa20.32■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.32■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.32■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.32■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.32■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 PALD1Q9ULE6 856 aa20.32■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 CSADQ9Y600 493 aa20.32■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 TBC1D12O60347 775 aa20.31■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 SGPL1O95470 568 aa20.31■□□□□ 0.84
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SFTPC-201ENST00000318561 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.31■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 C17orf99Q6UX52 265 aa20.31■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.31■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 CPA4Q9UI42 421 aa20.31■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.31■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.31■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 MYPNQ86TC9 1320 aa20.3■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 M0R2C6 588 aa20.3■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 GPAA1O43292 621 aa20.3■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 PRKAB2O43741 272 aa20.3■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.3■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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SFTPC-201ENST00000318561 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 CETPP11597 493 aa20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 GNAT2P19087 354 aa20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 HOXD10P28358 340 aa20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 INPP5BP32019 993 aa20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 TTC6Q86TZ1 520 aa20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.29■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 DOCK1Q14185 1865 aa20.28■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 FAM196BA6NMK8 535 aa20.28■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 SLURP2P0DP57 97 aa20.28■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.28■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.27■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.27■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.27■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 HIP1O00291 1037 aa20.27■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 SDSP20132 328 aa20.27■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SFTPC-201ENST00000318561 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.27■□□□□ 0.84
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